在这样的背景下，贞观五年九月二十六日，纵横司正式挂牌成立，因其特殊地位和特殊使命，虽然部门的等级为司，但是实际级别达到了六部级别，杜如晦的纵横司郎中职位不同于其他的郎中，一般而言六部各司的郎中职位都是从五品上的品级，而杜如晦的纵横司郎中则是正三品上的职位，直接对李二陛下负责，自此之后，尚书右仆射的职权则慢慢的被转移到了专掌国家对外情报和间谍战方向，左仆射负责对内的政务。